横扫中亚、西亚，跃马欧洲的成吉思汗（涂们 饰）62岁了。面对瘟疫肆虐，勇战沙场的蒙古将士不断倒下，杀人如麻的他，突感死亡的临近。如同历代帝王一样梦想长生不老之术。长春真人丘处机（赵有亮 饰）被传说300岁，懂生死，通晓治国治民之道深居于文登昆嵛山中。金和宋的皇帝曾派人 来请，均遭拒绝。成吉思汗闻知定要会他，命刘仲禄（耿乐 饰）不远万里一定要带回丘处机。
丘处机算出这一行自己将有去无回，但为了天下百姓免遭战乱之苦，丘处机带着一口棺材，毅然上路。而他的爱徒赵道安（余少群 饰），不愿师父一人前往西域受苦，甘愿一路随行。途中，一心想找成吉思汗报杀夫之仇的契丹女（李小冉 饰），三次变换身份，希望打动丘处机，带她一同前往西域。
一行人历经生死险阻，终于到达八鲁湾与成吉思汗相见。成吉思汗向丘处机索要长生不老之药，丘处机却直言“只有卫生之道，而无长生之药”。经过几番波澜不惊的心战，让成吉思汗明白了“天道喜善恶杀，珍惜别人的生命就是延长自己的生命”的道理。并教授蒙古将士们沐浴卫生，使瘟疫锐减。顿悟后的成吉思汗停止了征伐的脚步，班师东归。封丘处机为大国师。
剧情版本二：电影《止杀令》讲述了全真教道长丘处机西行万里，力劝成吉思汗止杀东归的真实故事。影片横跨南北六省实景拍摄，以大气磅礴的电影画面和气势恢弘的战争场面，配合亚洲一流的特效，再现了那场震惊世界的成吉思汗大军的西征。与此同时，《止杀令》将丘处机“一言止杀”，规劝成吉思汗班师东归的千古之谜首次展现于大银幕之上。
幕后花絮：
余少群说他演的不是尹志平，为了让每个好奇的人都信服他的说法，他还特别做了很多的功课。他说赵道安是历史上的真实人物，据他了解，赵道安在历史上是唯一随同丘处机西行的弟子，武功非常高强，这个角色献出了他从影以来最多的打戏
李小冉说她在片中的造型多变，青楼女子、蒙面土匪、客栈老板娘，而且她还尝试了小道士。她说自己对小道士造型也非常满意，原因就是不用怎么化妆。
王坪说他是丘处机的老乡，他的事迹我仔细的研究过，但电影篇幅有限，只表现了他善良的一面，而成吉思汗我们对他的认识多在他于战争方面取得的成就，对止杀了解不多，这个电影就是通过他将和平的理念传到西方。
王坪说他每一个镜头推到近景甚至特写的时候，都能看清演员的面目表情，镜头里传递的信息更真实、更有血有肉、更有感情，他不仅要求影片在场面上实景还原，而且对每一个参与的演员都要求真情演绎，入木三分，都用心与影片和观众对话。
耿乐说他在这个电影里最大挑战是骑马戏了，开拍前自己心里挺打鼓的，因为我从没骑过这么快的马，以前拍骑马戏，那马大概也就是颠两下然后就停了，没有过这么大篇幅的、长时间的骑马。足足几个月啊，每天在马上摔来摔去的。
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