故事发生在十九世纪末的伦敦，彼时对于尸体的研究已经到达了极致，死亡并非一切的终结，那些灵魂消散肉身却永存的人们被称为“尸者”，被视作廉价而又高效的劳动力。华生（细谷佳正 配音）是一名资历优异的医学生，他的好友Friday（村濑步 配音）死于非命，追寻着好友生前的意愿，华生违反政府规定私自将其制成尸者。
华生的这一举动令他被卷入了名为“沃尔辛厄姆”的谍报机构中，和Friday一起，他们踏上前往阿富汗的旅途寻找《维克多手记》，手记的主人是弗兰肯斯坦博士，手记中记载了制造拥有意识的尸者The One的方法，而目前最有可能拥有手记者，是一位名叫卡拉马佐夫（三木真一郎 配音）的牧师。
作品术语：
尸者技术
通过给失去灵素的尸体安装虚拟灵素，使其能够复生以执行特定的行动的技术。由维克多·弗兰肯斯坦于约一百年前确立。通过安装特定的插件可以使尸者能够执行具体工作。在1878年的今天，尸者已经作为基础设施广泛应用于世界各地。而尸者技术则受国家控制。所有尸体都需要编上识别编号，尸者技术的个人运用则被禁止。
2. 华生与星期五
华生曾与星期五一同，致力于证明灵魂存在的实验。可是壮志未酬，星期五就病倒了。那时，华生与星期五相约：作为尸者复活的星期五，要是能够再度获得灵魂，会用钢笔向华生送出暗号。华生的名字来自柯南·道尔《福尔摩斯探案》系列小说；而星期五则是丹尼尔·迪福小说《鲁宾逊漂流记》中的人物。
3. 大博弈（Great Game）
指大英帝国与沙皇俄国争夺中亚霸权的战略冲突，词源是国际象棋中的博弈。英俄两国均广泛以间谍活动为中心开展谍报战。沃尔辛厄姆机构是大英帝国的谍报机构，其名源自16世纪伊丽莎白一世时期建立秘密警察系统的政治家弗朗西斯·沃尔辛厄姆。
4. 伦敦
大英帝国的首都。1878年正值维多利亚时代，如火如荼的工业革命将大英帝国推向最高峰。作中，尸者技术是帝国繁荣昌盛的基础之一。
此外，政府所有的巨大分析机「查尔斯·巴贝奇」位于伦敦塔内。原伦敦大学医学生的华生作为特务前往的，则是英国殖民地英属印度帝国的孟买。
5. 英属印度帝国～伽师
华生在孟买与英国陆军军官伯纳比汇合。现实中的伯纳比出生于1842年，1875年冬季开始骑马访问位于现乌兹别克斯坦附近的希瓦汗国并著书《希瓦骑行记》。他们从维多利亚车站乘火车前往卡拉奇，再乘船沿印度河逆流而上，在那里与俄国特务尼古拉·克拉索托金接触。在开伯尔山口的战斗中，能看到指挥第二次英国-阿富汗战争的布朗将军的身姿。
6. 尸件（Necroware）
尸者化的操作顺序是：①获得尸体。②切开延髓，将灵素注入机深深插入其中。灵素注入机以碳锌电池（剧中的12年前，1866年由法国科学家勒克朗谢发明）为电源，通过打孔卡读卡器写入控制系统。③根据尸者的使用目的，在控制系统上安装工作需要的插件。控制系统、插件等控制尸者活动的软件，统称为尸件。
7. 新型尸者（Global Entrainment）
让尸者像生者一般活动的四肢控制技术。虽然其内幕曾一度不明郎，但卡拉马佐夫通过向生者强行写入虚拟灵素使其尸者化的方法将其实现。尸者技术有三个基本原则：①禁止制造无法与生者相区别的尸者。②禁止制造超越生者能力的尸者。③禁止向生者写入灵素。卡拉马佐夫的研究触犯了第三原则。
8. 阿列克塞·卡拉马佐夫
卡拉马佐夫通过鸦片和音乐的力量，让生者进入变性意识状态（即催眠状态，让人拥有全知全能感、幸福感等的特殊的精神状态）实现向生者写入虚拟灵素。卡拉马佐夫的名字来自费奥多尔·陀思妥耶夫斯基的小说《卡拉马佐夫兄弟》。尼古拉也来自同一小说。又及，向尼古拉注入虚拟灵素的场景中，操作分析机的留胡须的尸者，是卡拉马佐夫兄弟中的长子，德米特里。
9. 东京
明治12年（1879年），刚刚结束明治维新的日本。华生一行在日本桥附近的相扑巡演会场上与帝国陆军军官山泽静吾相遇，一同前往大里化学回收起藏匿的《维克多手记》。大里化学的名字来自以日本为舞台的电影《007之雷霆谷》中登场的企业。虽然华生得到并让星期五解析了手记，但其后突然出现的The One夺走了手记。同时，华生被生物兵器尸者感染了霍乱。
10. 山泽静吾
原萨摩藩士。明治维新后加入陆军，1877年作为观战武官派赴俄土战争，并参加普列文要塞一战。剧中观看相扑时，本人亦提及这件事。又及，山泽当时看到俄军陷入苦战，不假思索地加入了战斗，成为一段趣闻。其与尸者作战时的喝声被称为「猿啼」。
11. 维克多手记
记载有一百年前，维克多·弗兰肯斯坦制造最初的尸者The One时的记录。只有The One拥有灵魂的秘密，据信也记载在其中。其实际是由多张打孔卡组成的，需要通过分析机来解读。在大里化学华生让星期五解析了手记。其结果，在旧金山的暗渠里星期五的灵魂得以苏醒。但是，手记也在大里化学被The One夺走。
12. 美国·旧金山
华生在去往美国的里士满号上与哈达莉·莉莉丝重逢。哈达莉是美国前总统尤利西斯·格兰特的秘书。格兰特现在与民间军工企业合作在世界各地宣传尸者技术。格兰特的名字源自真实的美国总统。在旧金山，The One利用分析机「保罗·班扬」施放出手记的力量，发出特殊的声波让尸者失控。在这混乱之中，星期五一瞬之间灵魂得以恢复。
13. 鹦鹉螺号
从英国俘获，经发明家托马斯·爱迪生改造后的潜艇「USS鹦鹉螺号」。哈达莉·莉莉丝也是爱迪生所制造的人型机器人。哈达莉是维利耶·德·阿达姆科幻小说《未来夏娃》中登场的人型机器人的名字。莉莉丝是犹太教传说中的女性恶魔，同时也是在夏娃之前的「最初的女性」。爱迪生的原型当然是被称为门罗帕克的魔术师的发明家。
14. M与The One
M试图通过让尸者失控，触发人们进入变性意识状态，以强制写入尸件进行尸者化。他认为，如果人类不存在意识，那么就不会有争端。在鹦鹉螺号上，华生在星期五耳中塞入了降噪器，所以星期五不会失控。
The One的目的，则是复活封印在维克多大脑中的「新娘」的灵魂。The One打算以哈达莉作为复活以后灵魂的容器，而The One自己的灵魂则移动到星期五体内。
15. 分析机
列强均各自设置有分析机，以进行尸件的更新等运算。The One的台词中提及的「八大分析机」是与大英帝国的「查尔斯·巴贝奇」相连接的奥丁、伊凡、波尔·班扬、格兰·拿破仑、山姆大叔、克里希那、女娲、黄帝。查尔斯·巴贝奇这一名字来自设计出史上第一台可编程计算机的同名数学家。
16. 当一切结束后
华生使用灵素注入机把《维克多手记》的内容封印在自己的脑中。同时，失去了追寻手记的旅程中的所有回忆。4年之后，华生成为了私人侦探夏洛克·福尔摩斯的助手。哈达莉则化名艾琳·艾德勒（《福尔摩斯探案》系列短篇小说《波希米亚丑闻》中登场的人物 ）。星期五或许已经获得了意识，怀着对华生的思念，远远眺望他的身姿，脸上隐约浮现出微笑。
（译注：在最后的场景中，除了哈达莉之外，所有人的眼瞳都失去了光泽，这意味着什么呢。）
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